Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms