Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms