Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms