Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC18Q8N456 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms