Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms