Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms