Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms