Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms