Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms