Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.531e-11■■■■■ 32
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PRPF8Q6P2Q9 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.541e-11■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.571e-11■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.781e-11■■■■■ 32
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PRPF8Q6P2Q9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 32
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PRPF8Q6P2Q9 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 31.9
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PRPF8Q6P2Q9 PAPD4-209ENST00000505571 781 ntTSL 32.82□□□□□ -1.962e-8■■■■■ 31.9
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PRPF8Q6P2Q9 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -16e-7■■■■■ 31.9
PRPF8Q6P2Q9 INTS10-213ENST00000522114 623 ntTSL 419.7■□□□□ 0.742e-17■■■■■ 31.9
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