Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPRIN2Q6IMN6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms