Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms