Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms