Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms