Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A3Q5K4L6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms