Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6CQ53S08 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms