Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms