Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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