Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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