Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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