Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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CNGA3Q16281 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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CNGA3Q16281 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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