Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TWIST1Q15672 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms