Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms