Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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SIX1Q15475 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SIX1Q15475 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SIX1Q15475 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SIX1Q15475 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SIX1Q15475 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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