Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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