Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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