Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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