Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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