Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 24.9□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 SRSF7-207ENST00000432873 603 ntTSL 34.76□□□□□ -1.652e-10■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 DHX9-204ENST00000477802 456 ntTSL 24.59□□□□□ -1.672e-10■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 54.01□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 317.12■□□□□ 0.337e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-205ENST00000469609 2384 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.617e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.647e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.857e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 28.74□□□□□ -1.017e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.067e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-208ENST00000491670 941 ntTSL 27.85□□□□□ -1.157e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.287e-7■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.61e-11■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.571e-11■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 418.75■□□□□ 0.593e-22■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 LMNB1-206ENST00000492190 738 ntTSL 317.88■□□□□ 0.453e-22■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-11■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-11■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-11■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 35.42□□□□□ -1.543e-22■□□□□ 8.3
PUM1Q14671 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-10■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 AKAP9-209ENST00000484815 671 ntTSL 27□□□□□ -1.292e-10■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.962e-10■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 SMARCC2-204ENST00000547356 741 ntTSL 223.92■■□□□ 1.428e-13■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 SMARCC2-210ENST00000550519 789 ntTSL 323.55■■□□□ 1.368e-13■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 SMARCC2-211ENST00000550859 656 ntTSL 35.71□□□□□ -1.58e-13■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PSMA4-212ENST00000559365 786 ntTSL 528.58■■■□□ 2.174e-9■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)20.85■□□□□ 0.934e-9■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 219.64■□□□□ 0.734e-9■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 SUPT6H-210ENST00000584285 446 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-25■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-9■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.074e-9■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-9■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.344e-9■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 24.83□□□□□ -1.645e-10■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.04□□□□□ -1.764e-13■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 57.2□□□□□ -1.261e-28■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -25e-7■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 USP48-214ENST00000532737 680 ntTSL 425.02■■□□□ 1.66e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.86e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 519.72■□□□□ 0.756e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.676e-8■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.536e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PRPF31-209ENST00000498612 881 ntTSL 518■□□□□ 0.476e-8■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt17.1■□□□□ 0.336e-8■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.156e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.096e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.086e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-208ENST00000442734 828 ntTSL 215.47■□□□□ 0.076e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.126e-8■□□□□ 8.2
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PUM1Q14671 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.84□□□□□ -0.196e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.636e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 C11orf58-208ENST00000527893 813 ntTSL 410.25□□□□□ -0.776e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.866e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.876e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-205ENST00000422745 1865 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.96e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 USP48-212ENST00000527823 554 ntTSL 49.22□□□□□ -0.936e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-210ENST00000448127 579 ntTSL 28.5□□□□□ -1.056e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-207ENST00000437657 745 ntTSL 58.44□□□□□ -1.066e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-213ENST00000454046 1947 ntTSL 58.09□□□□□ -1.116e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.136e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 APLP2-206ENST00000525215 478 ntTSL 27.34□□□□□ -1.236e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 C11orf58-205ENST00000525106 549 ntTSL 26.88□□□□□ -1.316e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 CEP350-203ENST00000417046 2724 ntTSL 25.97□□□□□ -1.456e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.466e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 25.89□□□□□ -1.476e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 DHX15-202ENST00000503562 727 ntTSL 25.27□□□□□ -1.576e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 CEP350-205ENST00000429851 6096 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.586e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 CEP350-211ENST00000496440 765 ntTSL 54.87□□□□□ -1.636e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 CEP350-209ENST00000490141 3549 ntTSL 24.67□□□□□ -1.666e-8■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 APLP2-205ENST00000461918 553 ntTSL 34.01□□□□□ -1.776e-8■□□□□ 8.2
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