Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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