Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ERV3-1Q14264 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ERV3-1Q14264 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ERV3-1Q14264 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ERV3-1Q14264 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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ERV3-1Q14264 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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