Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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