Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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