Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD2Q13563 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2Q13563 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
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