Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEUROD1Q13562 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms