Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATRQ13535 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATRQ13535 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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