Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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TOP3AQ13472 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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TOP3AQ13472 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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TOP3AQ13472 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TOP3AQ13472 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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