Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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