Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.5 ms