Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
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