Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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