Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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