Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP3Q12983 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms