Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTP4A2Q12974 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTP4A2Q12974 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTP4A2Q12974 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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