Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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