Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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