Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms