Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms