Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms