Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEX3Q00994 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEX3Q00994 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEX3Q00994 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms